悪の帝国・大星団ゴズアと戦うチャージマーメイドこと葵七海は敵の攻撃を受け傷を負ってしまった。その際に彼女を助けた森山翔太は、自分が両親から受け継いだ下町の町工場・森山製作所で七海をかくまうのだった。翔太や古株の従業員・清水源治の仕事を手伝いながら、束の間の休息を得る七海。そして森山製作所は偶然にも「人間の力を10倍にも増幅させる未知なるエネルギー」である超電子エネルギーを発見してしまう。彼らはそのエネルギーを利用すべく、充電し運用できる『超電子バッテリー』の開発を試みる。一方町では人々を誘拐し、洗脳・改造手術を施した『人間マシン』を開発する謎の犯罪組織『プラント』が暗躍していた。より強力な人間マシンを欲するプラントは超電子バッテリーに目をつけ、チャージマーメイドと森山製作所に襲い掛かる！そしてついに超電子バッテリーをめぐって正義と悪の戦いが幕をあげる！！【BAD END】