ずっと探してる。境界線の向こうの、きみを――時計仕掛けのレイライン、最後の幕がついに開く。夜ごと学園に現われていた『夜の世界』は崩壊し『夜の生徒』たちは消え去った。20年前に起こった学園での火事が、すべての原因ではないかと考える主人公たちは、『夜の生徒』として消えた仲間と再会するためにも、事件の詳細を調べ始める。一方、姿を消していた学園長は、『夜の世界』を復活させるために密かに動き出した。20年前に一体学園では何があったのか？時を操る魔女、クラール・ラズリットはどうしているのか？そして夜の生徒たちは今…。学園にまつわるすべての謎が、いよいよ明らかに。